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Smarter way for the Best 2020.02.28
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Transcription Regulation 분석! Chromium Single cell ATAC solution으로 연구하세요!
2019 Top 10 Innovations : Chromium single cell ATAC solution
Chromium single cell ATAC solution이 생명과학 분야에서 2019 Top 10 Innovations 로 선정되었습니다! 10x Genomics사는 ATAC-seq방법을 개발한 Epinomics사를 인수하여 Next GEM technology를 적용한 single cell ATAC solution을 출시하였습니다. Enhancer에서 gene 영역에 이르기까지 genome-wide regulating 정보를 확인할 수 있는 Chromium single cell ATAC solution을 만나보세요.

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2019 Top 10 Innovations article – No.9
Workflow & Consideration
Single cell에서 추출한 nucleus에 transposase 효소를 처리하여 open chromatin영역을 잘라내 NGS sequencing을 진행합니다. 이 결과를 transcription factor 영역에 mapping시켜 분석합니다. 실험에 있어 가장 중요한 부분은 sample 준비입니다. Sample 준비와 관련한 정보를 아래의 webinar를 통해 확인하실 수 있습니다.
Webinar 보러 가기
Getting Started with Single Cell ATAC Sequencing
Chromium single cell ATAC solution을 활용한 연구 사례
single cell ATAC solution을 사용하여 진행한 연구자들의 논문도 확인해 보세요.



Chromium single cell gene expression solution과 single cell ATAC solution을 모두 활용한 연구사례. MPAL(mixed phenotype acute leukemia) 환자의 malignant specific TF를 발견하여 gene expression과의 상관관계가 있음을 확인하였음

연구논문 자세히 보기
A single cell framework for multi-omic analysis of disease identifies malignant regulatory signatures in mixed phenotype acute leukemia


anti PD-1 치료제를 처리한 환자의 immune cell을 분석하여, intratumoral exhausted T cell과 CD4 helper T cell을 규제하는 공통적인 인자를 확인한 연구 사례

연구논문 자세히 보기
Massively parallel single-cell chromatin landscapes of human immune cell development and intratumoral T cell exhaustion

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