News & Event

조직 미세환경은 세포의 특징 및 기능, 질병 메커니즘, 그리고 치료 반응에 강력한 영향을 미칩니다. 공간 전사체 프로파일링(Spatially resolved whole transcriptome profiling)은 조직에서 유전자 발현 패턴을 공간적으로 정밀하게 분석할 수 있으며 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 특성화 할 수 있게 합니다.  이번 웨비나는 Spatial transcriptome을 이용한 국내 연구사례와 10x Genomics의 신제품 Visium HD에 대한 내용으로 구성하였습니다. 특히, 연구사례로는 심근경색 동물모델을 사용하여 심근경색 직후의 ‘염증반응기’에서부터 ‘회복기’까지의 면역세포 특성과 역동성을 단일세포 및 공간전사체 분석기술로 연구한 결과를 소개해 드릴 예정입니다. 또한, 10x Genomics의 최신 제품인 Visium HD는 조직 내에서의 전체 전사체의 발현 및 공간 정보를 단일 세포 해상도로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 조직 커버리지에 간격 없이 공간 분석이 가능하며, Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 고해상도의 데이터 품질과 정확한 전사체 공간 정보를 제공합니다. 또한, 이 제품은 보관된 FFPE 블럭 또는 절편화된 조직에서도 사용할 수 있어 데이터 확보에 있어서 이전보다 뛰어난 접근성을 제공합니다.  미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 정확히 정의하고 희귀 세포군을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형에 특이적인 바이오마커 및 약물 표적을 식별 수 있는 10x Visium Spatial Platform에 대한 웨비나에 많은 관심과 참여바랍니다. 연자 소개     Spatiotemporal dynamics of immune cell heterogeneity related to inflammatory responses based on single-cell and spatial transcriptomics​​정승현 교수/Seung-Hyun Jung, PhD가톨릭대학교 의과대학 (생화학교실)    Enter a new era of spatial discovery with Visium HD ​고유정/Yujeong Gho(주)다온비에스/Field Application Specialist

조직 미세환경은 세포의 정체성과 기능, 그리고 질병 메커니즘 및 치료 반응에 매우 큰 영향을 미칩니다. 공간적으로 해결된 전체 전사체 프로파일링은 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 확인할 수 있게 합니다. Visium HD Spatial Gene Expression은 조직 커버리지에서 빈 공간 없이 단일 세포 수준에서 전체 전사체를 공간적으로 분석하며, 이를 통해 새로운 발견 가능성을 높입니다.Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 한 Visium HD는 보존되어 있거나 미리 절편화된 FFPE 조직에 대해 이전에 없던 고품질의 정밀한 전사체 공간 정보를 제공합니다.마이크론 크기의 조직 단위로 포괄적인 전사체 정보를 얻어 미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 확인하고, 조직 내 희귀 세포군의 역할을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형별 특이적인 바이오 마커 및 약물 타킷을 식별할 수 있습니다.이번 웨비나를 통해 Visium HD Spatial Gene Expression을 이용한 새로운 공간적 발견을 경험해 보십시오.- 단일 세포 해상도로 전체 전사체(whole transcriptome) 분석- 캡쳐 영역에 속한 조직 절편 전체 커버리지- 혁신적인 probe와 Visium CytAssist을 이용한 워크플로우를 통해 최고의 데이터 획득연자    Geoff McDermott PhDSenior Science & Technology Advisor10x Genomics

뇌 조직과 종양 생검 등 매우 이질적인 샘플의 단일 세포 분석을 통해 얻은 세포 데이터는 유용한 생물학적 통찰력을 제공합니다. Chromium Single Cell Gene Expression Flex와 같은 혁신적인 기술은 fresh, frozen 그리고 fixed sample, 심지어 FFPE 샘플에 대해 높은 민감도와 유연한 워크플로우를 제공하여 발견 가능성을 넓힙니다. 그러나 이러한 발전된 단일 세포 전사체 분석 기술을 사용하려면 그 기능에 상응하는 소프트웨어 도구가 필요합니다. 이번 웨비나에서는 이미 검증된 Loupe Browser의 새로운 기능을 소개합니다. Loupe 7.0에 대한 기능과 Flex tutorial dataset를 활용한 안내를 통해 아래 내용들을 배울 수 있습니다.Seamlessly move between Loupe 7.0 and community-developed tools written in R using our new .cloupe conversion package, LoupeRPerform multi-sample comparisons between two experimental conditions using a pseudo-bulk approachReveal cell types present across lung cancer disease states and gene expression changes before and after therapeutic treatments연자Loupe & LoupeR: new ways to analyze data & collaborate    Emily GranthamScientist, Applied Bioinformatics

유전자 발현 정보를 형태학적 맥락과 함께 평가하는 것은 생물학과 질병의 진행을 이해하는데 중요합니다. 복잡하고 이질적인 조직을 high-throughput 방식으로 분석하는 것은 어려운 과제였으며, 특히 유전자 발현에 대한 사전 생성된 가정 없이 이를 수행하는 것은 더욱 어려웠습니다.​다온비에스에서 진행하는 이번 웨비나에서는 Visium Spatial 제품을 사용하여 H&E 또는 면역 형광 염색된 fresh frozen 또는 FFPE 조직 절편의 전사체를 분석하는 방법을 소개해 드릴 예정입니다. 또한 공간 분석 방법, 샘플 처리 방법, 데이터 분석 워크플로우에 대한 정보를 얻을 수 있습니다.세션1: 공간 분석 - 실험 설계, 분석 및 모범 사례세션2: 공간 데이터 분석 - QC에서 시각화까지의 워크플로우연자 소개    유지숙(주)다온비에스 / Field Application Specialist    손승한(주)다온비에스 / Field Application Specialist

식물은 우리의 건강과 영양에 기본적이며, 아직 발견되지 않은 많은 중요한 천연 약물을 제공합니다. 식물 생물학에서 중요한 과제 중 하나는 식물이 다세포 생물체이지만 발견해야 할 많은 점들은 식물의 단일 세포의 분리 및/또는 농축을 필요로 합니다. 부드러운 세포 분류는 유전자 특성 및 기능, 단백질체학 및 전사체학, 단일 세포 유전체학, 유전자 편집 또는 유전자 공학을 통한 개량된 세포주 개발, 우수한 품종을 생산하기 위한 식물 생물학 워크플로우의 효율성을 높이는 유용한 도구입니다.전통적인 cell sorter에서는 식물 protoplast 및 엽록체와 핵과 같은 소립자들을 분리하는 것이 높은 시료 압력, shear stress 및 삼투압 등의 변화로 인해 후속 응용에 사용할 수 없게 됩니다. Microfluidic 기술을 활용한 WOLF G2® 세포 분류기는 낮은 시료 압력과 customizable sheath fluid를 사용하여 세포의 생명력과 세포막 무결성을 지원합니다.이번 웨비나에서는 특히 아래와 같은 내용을 다룰 예정입니다.FACS 장비를 이용한 식물 세포를 분류시 한계식물 세포 생명력을 보존하기 위한 맞춤형 시액 유체와 낮은 시료 압력의 중요성WOLF G2를 이용한 protoplast, 핵 및 배아형성 미세포를 농축 및 분류하여 단배체 식물로 재생하는 능력 소개Speaker    Dorinda MoelleringSenior Scientist at NanoCellect  Dorinda Moellering is a Senior Scientist at NanoCellect Biomedical and a member of the applications development team.  She develops applications for cell sorting in plant/agriculture, marine biology, and mammalian research spaces.  She has over 15 years of biotech industry experience – five years working on algal biofuels, and a decade in plant cell biology and flow cytometry.  Her undergraduate and graduate research studies focused on understanding biological processes and roles of numerous phytoplankton species which are key to carbon fixation in the world's oceans.  Dorinda has a Master of Science degree in Molecular and Cellular Biology from California State University San Marcos and a Bachelor of Science degree in Marine Biology from the California Polytechnic State University San Luis Obispo.