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제34회 한국유전체학회 정기학술대회에서 다온비에스는 런천세미나 및 부스전시를 진행합니다.이번 런천세미나에서는 단일 세포 분석에서 공간 생물학으로 확장되는 연구 트랜드에 맞춰 10x Genomics의 첨단 멀티오믹스 기술과 고객 연구 사례를 함께 소개해 드립니다. 다중 오믹스 분석을 통해 면역 역설 현상을 분자수준에서 규명한 연구로, 고돌연변이부담 폐암에서 DDX54가 매개하는 면역배제 기전을 밝힌 연구결과입니다.연구자 분들의 관심과 참여 부탁드리며, 다온비에스 부스에서도 최신 플랫폼에 대한 상세한 상담이 가능하오니 꼭 방문해 주시기 바랍니다.연자소개   12:20 - 12:40    세포에서 공간으로 확장되는 10x Genomics 최신 멀티오믹스 기술 소개From Cells to Space: 10x Genomics Innovations in Untethered Multiomic Profiling 유지숙 과장(주)다온비에스 기술지원부  12:40 - 13:20    다중 오믹스 분석을 통한 면역 역설의 분자적 해석: 고돌연변이부담 폐암에서 DDX54 매개 면역배제 기전 규명Molecular dissection of the immune paradox through multi-omics analysis: Elucidating DDX54-mediated immune exclusion mechanisms in high-TMB lung cancer공정렬 박사KAIST  [발표 초록]고돌연변이 부담(TMB-H)은 면역관문억제제(ICI) 치료 반응성을 예측하는 바이오마커로 알려져 있다. 그러나 The Cancer Genome Atlas (TCGA) 전사체 데이터 분석에서, 우리는TMB-H 종양의 약 30%는 T 세포 침투가 거의 없는 '면역 사막형(immune-desert)' 폐암으로 분류되어 ICI 치료에 저항성이 있음을 확인하였다. 이러한 역설적인 면역학적 현상의 분자적 기전을 규명하기 위해, 본 연구에서는 암 전사체 데이터 (RNA-seq), 단일세포 전사체 (single-cell transcriptomics), 공간 전사체(spatial transcriptomics)를 통합한 다중 전사체 기반 분석을 수행하여 TMB-H 폐암에서 면역 배제를 유도하는 조절자를 규명하고자 하였다. 우선, 우리는 유전자 조절 네트워크 모델링을 분석을 통해서 DEAD-box helicase 54 (DDX54)를 면역 회피를 유도하는 마스터 조절자로 발굴하였다. 이어서 폐암에서 DDX54를 억제하면, 폐암 종양 내부로 면역세포 침투가 증가하고 anti-PD1 치료 감수성이 회복됨을 실험적으로 검증할 수 있었다. 결론적으로, 본 연구는 다양한 전사체를 통합하여 면역-온코타겟(immuno-oncotarget) 규명을 위한 시스템 수준의 분석 틀을 제시하며, TMB-H 종양에서 ICI 저항성 극복을 위한 유망한 전략으로 DDX54 억제를 제안한다.

“Spatial proteomics”는 Nature methods의 “Method of the year 2024”로 선정된 만큼 주목받는 분야입니다.이번에 새롭게 국내에 선보이는 Syncell의 MICROSCOOP® Mint 시스템은 현미경으로 이미징한 샘플에서 선택한 ROI(region of interest)의 protein을 추출할 수 있는 플랫폼으로 spatial proteomic discovery를 위한 솔루션을 제공합니다.FFPE/fresh frozen tissue 또는 fixed cell과 같은 다양한 샘플에서 350nm의 뛰어난 resolution으로 원하는 protein을 labeling할 수 있으며, 최종적으로 mass spectrometry 분석을 진행할 수 있도록 추출한 샘플을 enrichment하는 과정도 지원합니다. 시스템 내에는 AI 기반 자동화 기술이 적용되어 있어 연구자들이 spatial proteomics 연구를 빠르고 높은 정밀도로 수행할 수 있도록 돕습니다.본 세미나에서는 MICROSCOOP® Mint 시스템 소개와 더불어 간단한 적용사례를 소개해드릴 예정으로, 새로운 연구 기법을 이용하여 spatial proteomics를 진행해보고자 하셨거나, 바이오마커를 포함한 새로운 단백질을 발굴하고자 하셨던 연구자분들께 도움이 되기를 바랍니다.연자소개       김지현 부장  다온비에스

10x-pert Data Analysis Workshop 2025Single-cell 데이터 분석 워크샵: COVID-19 중증도 관련 유전자 시그니처 탐색[긴급안내] 워크샵 장소 변경: 가톨릭대학교 옴니버스파크 1층 TBL 1실​단일세포 데이터 분석은 다양한 세포의 유전자 발현 정보를 정밀하게 해석하기 위한 과정으로, 여러 단계의 분석 절차와 도구가 요구됩니다. 본 워크샵에서는 공개된 COVID-19 PBMC 데이터를 활용하여 단일세포 분석의 전 과정을 함께 실습할 예정입니다. 주요 분석 단계에는 원시 데이터 전처리, 샘플 디멀티플렉싱, doublet 제거 및 품질 관리, 배치 효과 보정과 통합, 자동 세포 주석, 그리고 다중 샘플 간의 발현 차이 분석 등이 포함됩니다.​초기 데이터 처리는 10x Genomics의 웹 기반 분석 도구인 10x Cloud Analysis를 활용하여 Cell Ranger 기반으로 진행하며, 이후 단계에서는 10x 및 커뮤니티에서 개발한 다양한 분석 툴을 함께 사용하여 각 분석 알고리즘에 익숙해질 수 있도록 구성하였습니다.이러한 일련의 분석을 통해 COVID-19 중증도와 연관된 세포 유형별 유전자 시그니처를 규명해볼 수 있으며, 본 워크샵은 단일세포 분석을 처음 접하시는 연구자분들도 쉽게 따라올 수 있도록 설계되었습니다. 관심 있으신 분들의 많은 참여 바랍니다.워크샵 개요일시: 2025년 7월 16일 (수), 12:30-17:30 pm장소: 가톨릭대학교 옴니버스파크 1층 TBL 1실​인원: 30명 (선착순 마감, 연구실당 2명으로 제한)​참가자 혜택: 다과 및 음료 제공후원​: 가톨릭대학교 다형성연구소, BK21, 기초의학사업추진단강사 소개    Quy Xiao Xuan Lin, PhDSenior Scientist, Applied Bioinformatics10x Genomics 프로그램   12:30 - 13:00pm:  Registration  13:00 - 13:15pm:  Introduction  13:15 - 14:00pm:  Raw data preprocessing using 10x Cloud  14:00 - 14:20pm:  Data quality assessment  14:20 - 14:30pm:  Break  14:30 - 15:00pm:  Single cell data analysis flow and automatic cell annotation  15:00 - 15:30pm:  Practice session I  15:30 - 15:40pm:  Break  15:40 - 16:30pm:  Data integration and practice session II  16:30 - 17:00pm:  Multi-sample differential expression analysis and practice session III  17:00 - 17:30pm:  Q&A  요구사항 본 교육과정은 10x Genomics의 단일세포 유전자 발현(Chromium Single Cell Gene Expression) 분석 솔루션을 이미 사용 중이거나, 향후 도입을 고려 중인 연구자분들을 대상으로 합니다. Google Colab을 활용한 실습이 포함되어 있으므로, 구글 계정을 반드시 준비해 주시기 바랍니다. ※ 개인 노트북을 지참하여 참여하실 경우, 아래 컴퓨터 요구 사양을 충족해야 하며, 실습에 사용할  관련 dataset 다운로드와 Loupe Browser를 사전에 필히 설치해 주시길 바랍니다.  Loupe Browser 설치 가이드 및 다운로드Single-cell_workshop_materials.zipSingle-Cell_Data_Cloupe file ​(1) Windows Windows 10 (64-bit) or later16GB RAMSSD storage highly recommendedUpdated video/display drivers recommended100% scaling display setting recommended (2) mac OS macOS 10.15 (Catalina) or later16GB RAMSSD storage highly recommendedDefault display settings recommended서울 워크샵 후원  ※ Visium HD 데이터 분석 워크샵(대전) 참여를 원하시는 분은 아래 배너를 클릭해 신청해 주십시오.  

전 세계적으로 가축과 동물 연구는 건강, 생산성, 식품 안전성 향상을 위해 계속 발전하고 있습니다. 하지만 여전히 다양한 생물학적 과제를 해결하기 위해서는 세포 수준에서의 정밀한 이해가 필요합니다.이번 웨비나에서는 10x Genomics의 단일 세포 및 공간 전사체 분석 기술이 동물 질병, 면역 반응, 육질 개선, 지속 가능한 사육 전략 등 다양한 분야에 어떻게 활용되고 있는지를 실제 연구 사례를 통해 소개합니다. Chromium Single Cell, Visium Spatial, Xenium In Situ 플랫폼이 동물 생명과학 연구를 어떻게 혁신시키고 있는지 다양한 연구사례를 통해 설명드릴 예정입니다.또한, 최근 출시된 Visium HD 3' 기술도 함께 다룹니다. 이 기술은 기존 Visium의 장점을 유지하면서도, 단일세포 수준의 공간 해상도를 제공하는 차세대 플랫폼입니다. Species-agnostic polyA 기반 분석으로 다양한 동물 종에 적용 가능하며, CytAssist 장비를 활용한 정밀한 공간 캡처와 자동 분석 기능을 통해 연구 효율성과 데이터 품질을 크게 향상시킵니다.지금 웨비나에 등록하시고, 가축 및 동물 연구의 새로운 가능성을 직접 확인해보세요.연자소개    단일세포 및 공간 멀티오믹스를 활용한 가축 및 동물 연구의 새로운 인사이트 김혜경Field Application Specialist, (주)다온비에스    공간 생물학의 확장: Visium HD 3' 및 Xenium Protein 플랫폼 런칭 김명진Field Application Specialist, (주)다온비에스

10x Genomics와 다온비에스가 “Single Cell & Spatial OmiX Symposium Seoul”을 개최합니다.이번 심포지엄은 단일세포 및 공간 오믹스 연구의 최신 흐름을 한 자리에서 만나볼 수 있는 소중한 기회입니다. 국내외 석학들의 연구 사례와 최신 기술을 직접 들어보고, 실제 데이터를 활용한 분석 데모를 통해 단일세포 및 공간 전사체 분석의 새로운 가능성을 체감하실 수 있습니다. 연구자 간의 활발한 교류와 지식 확장을 위한 뜻깊은 자리가 될 것입니다.특히, 이번 심포지엄에서는 다음과 같은 주요 주제를 다룰 예정입니다.여러 국가가 참여하여 면역 다양성 지도를 구축한 AIDA 프로젝트한국을 대표하는 면역질환 단일세포 분석 국책 연구인 SCAID 프로젝트Single cell CRISPR screeningMultiomics 접근법을 활용한 줄기세포 연구종양미세환경 내 세포들의 상호작용 분석을 통한 암 연구영장류 감염 모델 기반 코로나바이러스 변이주 면역 반응 분석이처럼 다양한 최신 연구사례를 통해 단일세포 및 공간 오믹스 기술의 응용 가능성과 연구방향을 확인하실 수 있습니다.참가자 분들에게는 다과 및 점심이 제공되며, 사전 등록을 통해 무료로 참석하실 수 있습니다. 많은 관심과 참여 부탁드립니다.Speakers