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단일 세포 연구를 더 발전시키려면 어떻게 해야 할까요? 연구 결과에 집중된 요구가 계속해서 변화하고 있고, 이러한 변화에 대응할 수 있는 분석 도구가 있어야 합니다. 업그레이드된 GEM-X 기술 기반의 assay로 단일 세포 분석 연구를 더 진전시킬 수 있을 것입니다.10x Genomics의 차세대 GEM-X 기술은 single cell 3' gene expression 및 5' immune profiling assay를 지원하며, 검증된 Chromium 워크플로우에 높은 성능과 확장된 연구범위를 제공합니다.이번 10x Genomics 웨비나에서는 GEM-X에 관한 흥미로운 연구결과와 관련 데이터 등을 소개해 드릴 예정입니다.새로운 GEM-X 기반의 단일 세포 분석은 이전 버전과 비교하여 복잡한 샘플에서 민감도 향상더 빠르고 효율적인 microfluidic 기술을 통해 세포 캡처율을 80%까지 높이고 처리량도 2배 증가RNA 함량이 낮아 분석이 까다로운 호중구와 같은 백혈구도 효율적으로 캡처하여 생물학적 이해를 넓힘동일한 세포로부터 BCR/TCR 및 유전자 발현 정보를 얻어 해당 세포의 subtype과 clonotype간의 상관 관계 분석연자    Angela Churchill, PhDProduct Marketing Manager, Single Cell Applications10x Genomics    Jessica Terry, PhDPrincipal Scientist, Molecular Biology10x Genomics

조직 미세환경은 세포의 특징 및 기능, 질병 메커니즘, 그리고 치료 반응에 강력한 영향을 미칩니다. 공간 전사체 프로파일링(Spatially resolved whole transcriptome profiling)은 조직에서 유전자 발현 패턴을 공간적으로 정밀하게 분석할 수 있으며 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 특성화 할 수 있게 합니다.  이번 웨비나는 Spatial transcriptome을 이용한 국내 연구사례와 10x Genomics의 신제품 Visium HD에 대한 내용으로 구성하였습니다. 특히, 연구사례로는 심근경색 동물모델을 사용하여 심근경색 직후의 ‘염증반응기’에서부터 ‘회복기’까지의 면역세포 특성과 역동성을 단일세포 및 공간전사체 분석기술로 연구한 결과를 소개해 드릴 예정입니다. 또한, 10x Genomics의 최신 제품인 Visium HD는 조직 내에서의 전체 전사체의 발현 및 공간 정보를 단일 세포 해상도로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 조직 커버리지에 간격 없이 공간 분석이 가능하며, Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 고해상도의 데이터 품질과 정확한 전사체 공간 정보를 제공합니다. 또한, 이 제품은 보관된 FFPE 블럭 또는 절편화된 조직에서도 사용할 수 있어 데이터 확보에 있어서 이전보다 뛰어난 접근성을 제공합니다.  미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 정확히 정의하고 희귀 세포군을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형에 특이적인 바이오마커 및 약물 표적을 식별 수 있는 10x Visium Spatial Platform에 대한 웨비나에 많은 관심과 참여바랍니다. 연자 소개     Spatiotemporal dynamics of immune cell heterogeneity related to inflammatory responses based on single-cell and spatial transcriptomics​​정승현 교수/Seung-Hyun Jung, PhD가톨릭대학교 의과대학 (생화학교실)    Enter a new era of spatial discovery with Visium HD ​고유정/Yujeong Gho(주)다온비에스/Field Application Specialist

한국유전체학회 2024 동계심포지엄│ 전시참여 (부스위치: 22번)♣ 부스 소개다온비에스 부스에서는 gentle sample prep에서 single cell genomics, NGS에 이르기까지 다양한 솔루션에 대한 상담이 가능합니다. 최신 트렌드 및 신제품 정보, 기기 시연, 그리고 부스 토크와 같은 다양한 이벤트가 준비되어 있습니다. 학회 참가자 분들의 많은 관심 부탁드립니다.특히, 이번 부스에서는 매우 낮은 압력에서 세포를 분류할 수 있는 WOLF G2에 대한 시연과 10x Genomics의 신제품, Visium HD에 대한 "Booth Talk"을 진행할 예정입니다. Visium HD는 공간적 발견의 새로운 시대를 열며, whole transcriptomics의 발현과 공간정보를 단일세포 수준의 해상도로 분석할 수 있습니다. 이번에 출시된 Visium HD 슬라이드는 연속된 조직 커버리지를 가능하게 하며, 혁신적인 probe와 Visium CytAssist 워크플로우를 통해 최고 수준의 데이터 획득이 가능합니다.1. Gentle Sample Preparation: MARS System2. Gentle Cell Sorting: WOLF, WOLF G2 SL, WOLF G2 Sorter3. Single Cell Genomics: Chromium Single Cell Gene expressionChromium Single Cell FlexChromium Single Cell Immune ProfilingChromium Single Cell ATACChromium Single Cell Multiome ATAC + Gene expressionChromium Nuclei Isolation4. Spatial Genomics:Visium HD Spatial Gene Expression5. In SituXenium In Situ Analyzer6. NGS: Element AVITI Sequencer새로운 솔루션과 기술로 여러분을 만나길 기대합니다. 다온비에스 부스 (#22)에서 만나요!

조직 미세환경은 세포의 정체성과 기능, 그리고 질병 메커니즘 및 치료 반응에 매우 큰 영향을 미칩니다. 공간적으로 해결된 전체 전사체 프로파일링은 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 확인할 수 있게 합니다. Visium HD Spatial Gene Expression은 조직 커버리지에서 빈 공간 없이 단일 세포 수준에서 전체 전사체를 공간적으로 분석하며, 이를 통해 새로운 발견 가능성을 높입니다.Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 한 Visium HD는 보존되어 있거나 미리 절편화된 FFPE 조직에 대해 이전에 없던 고품질의 정밀한 전사체 공간 정보를 제공합니다.마이크론 크기의 조직 단위로 포괄적인 전사체 정보를 얻어 미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 확인하고, 조직 내 희귀 세포군의 역할을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형별 특이적인 바이오 마커 및 약물 타킷을 식별할 수 있습니다.이번 웨비나를 통해 Visium HD Spatial Gene Expression을 이용한 새로운 공간적 발견을 경험해 보십시오.- 단일 세포 해상도로 전체 전사체(whole transcriptome) 분석- 캡쳐 영역에 속한 조직 절편 전체 커버리지- 혁신적인 probe와 Visium CytAssist을 이용한 워크플로우를 통해 최고의 데이터 획득연자    Geoff McDermott PhDSenior Science & Technology Advisor10x Genomics

뇌 조직과 종양 생검 등 매우 이질적인 샘플의 단일 세포 분석을 통해 얻은 세포 데이터는 유용한 생물학적 통찰력을 제공합니다. Chromium Single Cell Gene Expression Flex와 같은 혁신적인 기술은 fresh, frozen 그리고 fixed sample, 심지어 FFPE 샘플에 대해 높은 민감도와 유연한 워크플로우를 제공하여 발견 가능성을 넓힙니다. 그러나 이러한 발전된 단일 세포 전사체 분석 기술을 사용하려면 그 기능에 상응하는 소프트웨어 도구가 필요합니다. 이번 웨비나에서는 이미 검증된 Loupe Browser의 새로운 기능을 소개합니다. Loupe 7.0에 대한 기능과 Flex tutorial dataset를 활용한 안내를 통해 아래 내용들을 배울 수 있습니다.Seamlessly move between Loupe 7.0 and community-developed tools written in R using our new .cloupe conversion package, LoupeRPerform multi-sample comparisons between two experimental conditions using a pseudo-bulk approachReveal cell types present across lung cancer disease states and gene expression changes before and after therapeutic treatments연자Loupe & LoupeR: new ways to analyze data & collaborate    Emily GranthamScientist, Applied Bioinformatics