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공간 전사체학은 조직의 형태학적 맥락을 유지하면서 조직 섹션에 대한 전체 전사체 정보를 매핑할 수 있는 획기적인 분자 프로파일링 기술입니다. 10x Genomics의 Visium CytAssist 장비를 통해 구현되는 Visium Spatial 분석기법은 FFPE, fixed, fresh frozen tissue 등에 적용될 수 있습니다.Visium CytAssist 장비는 표준 유리 슬라이드에서 Visium 슬라이드로 전사체 probe를 자동 이동시켜 줌으로써 공간 전사체 분석을 위한 시료 준비를 간소화 시켜 줍니다.이번 웨비나에서는 아래와 같은 내용들을 다룰 예정입니다.The importance of spatial gene expression analysis and applicationsThe ultimate flexibility researchers now have to access their samples of interest with Visium CytAssist–enabled workflows10x Genomics spatial product development on the Visium CytAssist instrumentSpeaker    Lauren GutgesellMolecular Biology Scientist10x Genomics

유전체학의 발전으로 유전자 조절에 대한 이해가 혁신적으로 변화했고, 발단 생물학부터 질병 연구에 이르기까지 다양한 분야에서 중요한 발견이 이루어졌습니다. 이러한 혁신을 이끌어 내는 도구 중 하나가 Dovetail Pan Promoter Panel이며, 이것은 유전자 조절의 복잡성을 쉽게 해독하기 위해 고안된 솔루션입니다.  이번 세미나에서는 학계 전문가를 초청하여 조절 유전체학의 연구사례를 살펴보고, Dovetail Pan Promoter Panel를 이용하여 유전자 발현의 숨겨진 비밀을 어떻게 풀어내는지에 대해 소개해 드릴 예정입니다. 연자 소개     Professor Yasuhiro MurakawaKyoto University Institute for Advanced Study (KUIAS)Dissecting human disease pathways using high-resolution chromatin contact mapsLarge-scale genome-wide association studies (GWAS) have yielded an increasing number of disease-associated genomic loci. However, the functional interpretation still largely remains unclear. Recently, it has become apparent that disease-associated genetic variants are often found within enhancers. Enhances act to strongly enhance the expression of their target genes in a cell-type specific fashion, by physically associating with their promoters. We have developed a 5’-end single-cell RNA sequencing approach to comprehensively map active enhancers from heterogeneous helper T cells. By integrating with GWAS datasets, we identified hundreds of human enhancers associated with autoimmune diseases. To gain important clues to human disease pathways, here we used Micro-C as well as promoter-capture Micro-C, methods that can analyze chromatin interactions with super-high resolution. We systematically identified target genes of these enhancers, revealing novel human disease molecular mechanisms. In sum, we provide a general framework to investigate molecular mechanisms underlying human diseases.    Myriam ElkhawandCustomer Success Manager, Dovetail Genomics Setting up the Dovetail® Pan Promoter Assay in the lab In this second talk, Myriam will delve into the details of Dovetail Pan Promoter protocol and library quality control measures that play a pivotal role in assessing the success of the assay. She will discuss best practices in carry out the assay, library QC, emphasizing the importance of stringent quality standards for reliable data analysis. She will also share the analysis pipeline for Dovetail Pan Promoter panels. 

연구자들은 최근 다양한 환자 샘플이나 시료에서의 변화, 여러 시점 및 기관에서 수집한 많은 샘플을 분석하기 위해 “단일세포 프로파일링”을 활용하고 있습니다. 이러한 연구를 위해서는 데이터 품질을 해지지 않으면서 샘플을 오랫동안 저장하고 처리하는 기능이 필요합니다.  Chromium Single Cell Gene Expression Flex는 위에서 소개한 기능들을 제공하며, 여러 샘플 유형에 대해 검증된 유연한 프로토콜을 제공합니다. 이번 웨비나에서는 Flex의 다양한 장점 및 세포 표면 단백질과 유전자 발현 정보를 동시에 분석하는 추가된 기능을 소개해 드릴 예정입니다.  Flexible protocols with optional stopping points to analyze fixed cells, nuclei, or tissue stored long-term or short-term without sacrificing data qualityValidated workflows for profiling protein together with whole-transcriptome gene expression in singleplex or multiplex formatsData from high-throughput, multiomic analysis of up to 16 multiplexed samples, including human PBMCs, mouse splenocytes, and complex dissociated tumor cellsComparisons between flow cytometry and Feature Barcode technology using Single Cell Gene Expression Flex Speakers     Angela Churchhill, PhDProduct Marketing Manager, Single Cell Applications10x Genomics    Snow Wu, PhDScientist10x Genomics    Ryan Stott, PhDScientist 2, Cell Biology & Applications10x Genomics    Kevin Chen, PhD.Scientist II, New Product Development10x Genomics

한국줄기세포학회 2023 연례학술대회│ 전시참여다온비에스 부스에 오시면 gentle sample prep에서 single cell genomics, NGS에 이르기까지 다양한 솔루션에 대한 상담이 가능합니다.Gentle Sample Preparation: MARS SystemGentle Cell Sorting: WOLF, WOLF G2 SL, WOLF G2 SorterSingle Cell Genomics: Chromium Single Cell Gene ExpressionChromium Single Cell FlexChromium Single Cell Immune ProfilingChromium Single Cell ATACChromium Single Cell Multiome ATAC + Gene ExpressionChromium Nuclei IsolationNGS: Element AVITI Sequencer다온비에스 부스 (#69)에서 만나요!

다양한 3D 유전체 구조 분석 솔루션을 제공하는 Cantata Bio (구. Dovetail Genomics)에서 웨비나를 진행합니다.이번 웨비나에서는 3D 유전체 구조 분석을 위한 실험을 설계하고, 실행하는데 필요한 내용들과 고려사항들에 대한 팁을 전달해 드릴 예정입니다. 또한, 라이브러리의 QC 방법과 데이터 처리를 위한 과정등을 소개해 드릴 예정이니 관심 있으신 분들의 많은 참여 바랍니다. 웨비나 주요내용 How to design a 3D Genomics experiment. What is involved in running a 3D Genomics experiment in the lab. How to navigate data processing and QC analysis. 연자 소개    Myriam El Khawand, Ph.D.  Senior Customer Success ScientistDovetail Genomics, part of Cantata Bio