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[최신 논문소개] NEW bioRxiv preprint: Visium HD reveals the spatial immune landscape

다온비에스 · 2024.06.28 · 250
10x Genomics 신제품 Visium HD 연구결과 소개

10x Genomics 팀이 최근 Visium HD를 이용하여 human FFPE colon cancer tissue에서 다양한 면역 세포 유형 및 세포들 간의 상호작용을 규명한 연구 결과를 발표했습니다. Visium HD는 whole transcriptome의 공간 정보를 단일 세포 수준에서 분석할 수 있는 기술입니다. 이번 연구 결과는 bioRxiv에 Preprint로 게재되었으며, 종양-면역 상호작에 대한 중요한 통찰을 제공합니다.


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주요 연구 내용 

 

  •  Visium HD와 Visium v2를 사용하여 FFPE 종양 조직의 포괄적인 세포 지도를 완성했으며, 정상 인접 조직의 벤치마킹 데이터를 포함하여 더욱 정밀한 분석이 가능해졌습니다.
  • Visium HD의 고해상도, 전체 전사체(whole transcriptome) 데이터를 이용하여 종양 주변부를 따라 대식세포 아형을 국지화하는 고유한 거리 기반 분석 방법을 개발했으며, 이를 통해 종양 미세환경에서의 세포 분포와 상호작용을 더욱 세밀하게 이해할 수 있습니다.
  • Visium HD와 더불어 Chromium Single Cell Immune Profiling 및 Xenium In Situ 기술을 활용하여 확장된 cytotoxic T-Cell 클론형을 확인했습니다. 이는 잠재적으로 종양으로 면역 세포를 유인하는 면역 틈새에 관여할 수 있는 중요한 발견입니다.

 

※ Pre-print dataset download