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Dovetail® HiChIP MNase Kit

Dovetail™ HiChIP MNase kit는 proximity ligation Technologies을 사용하여 genome의 공간정보를 캡처하는 Hi-C와 ChIP-seq의 장점을 결합한 제품으로 연구자가 특정 단백질에 의해 매개되는 protein-directed chromatin을 분석할 수 있습니다.

이 kit는 항체를 제외하고, NGS 라이브러리 생성 전에 포유류 시료에 대한 염색질 면역 침전 및 proximity ligation을 수행하는 데 필요한 모든 시약을 제공합니다. 이 kit는 illumina (Cat # 25004)용 Dovetail™ Library Module 및 Illumina sequencing을 위한 타사의 Paired-end library preparation kit와 호환됩니다.

제품특징

  • 단일 라이브러리에서 ChIP-seq 및 Hi-C 데이터를 함께 캡처
  • 8 개의 시료에 적용할 수 있는 ready-to-use 형태의 시약 제공
  • Nucleosome 수준의 해상도에서 염색질의 상호 작용을 매핑
See Your ChIP-seq Data in a Whole New Dimension

ChIP-seq을 통해서는 선형 공간에서의 염색체 정보만을 얻을 수 있기에 enhancer/promoter 상호작용 및 protein-directed chromatin 구조물이 유전자 발현에 어떠한 영향을 미치는 등을 분석하기 위해서는 더 많은 정보가 필요합니다.HiChIP은 ChIP-seq 데이터에 3D boost를 조절 요소와 조절 요소 사이의 공간적 관계가 유전자 발현에 어떤 영향을 미치고 질병 진행에 어떤 역할을 하는지 탐색할 수 있습니다.

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Get Nucleosome-Level Resolution

제한효소를 사용할 때, 인간 게놈의 대략 20%는 Hi-C로 검출되지 않을 수 있습니다. 이는 단백질 결합 부위 주변에 제한 효소 부위의 가용성에 따라 신호가 불필요하게 영향을 받을 수 있기 때문입니다. Dovetail HiChIP MNase 키트는 이를 극복하기 위해 서열 무관하게 염색체를 endonuclease 및 exonuclease activities로 절단하는 micrococcal nuclease (MNase)를 사용하여 염색체를 균일하게 단편화하고 가장 고해상도의 3D 게놈 구조물 (150-200 bp)로 매핑할 수 있습니다. 

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