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Equinox Library Amplification Kit

Equinox® Library Amplification Kits는 희귀 변이 검출, circulating cell-free DNA(cfDNA) 분석, 단일 세포 분석, hybridization capture 등 고도의 정밀성을 요구하는 연구를 위해 설계된 고성능 DNA 증폭 솔루션입니다. 특히, 초고정확도(ultra-high-fidelity) DNA polymerase를 포함하여 PCR 증폭 과정에서 오류를 최대 40%까지 감소시켜, 더 정확하고 신뢰도 높은 NGS 라이브러리 구축을 가능하게 합니다.

제품특징

  • 초고도의 정확한 DNA 증폭 – misincorporation 최소화로 민감도 향상
  • 균일한 시퀀싱 커버리지 제공 – 편향을 줄여 시퀀싱 경제성 극대화
  • 넓은 범위의 샘플 적용 가능 – 0.1 pg ~ 500 ng의 다양한 샘플과 GC 함량 15%~85%까지 지원
  • Low-input 샘플 및 자동화 워크플로우 지원 – 항체 기반 Hot Start PCR 기술 적용
  • Hybridization capture 워크플로우 최적화 – paramagnetic beads와 호환 가능
  • Equinox® Uracil Tolerant Library Amplification Kits와 함께 사용 시 bisulfite 변환된 DNA 증폭 가능  

◎ Applications

 

  • Low-frequency variant detection NGS assays, including those utilizing challenging samples such as FFPE and cfDNA
  • Hybridization capture workflows
  • Single-cell analysis
  • Whole genome sequencing
  • Amplicon sequencing
  • RNA-Seq
  • ChIP-Seq, ATAC-Seq, and associated epigenetic applications
  • Illumina and non-Illumina sample preparation workflows

◎ 유연한 키트 구성: 다양한 연구 환경에 맞춘 최적의 솔루션

 

Equinox® Library Amplification Kits는 high-efficiency, high-fidelity 증폭을 위한 최적화된 NGS 라이브러리 증폭 솔루션입니다. PCR buffer와 Hot Start 효소가 포함된 최적화된 master mix를 제공하여 샘플 투입량과 GC 함량의 변화에도 최소한의 편향과 오류로 안정적인 증폭 성능을 유지합니다. 또한, paramagnetic beads와도 높은 호환성을 보이며, 실험 목적에 따라 다양한 구성을 선택할 수 있습니다.

  

 

Equinox Library Amplification Kit (2X Master Mix) 

  • Ultra-high-fidelity polymeras 포함
  • 2X master mix format으로 간편한 사용
  • 고감도 연구에 적합
 

Equinox HC (High Concentration) Library Amplification Kit (4X Master Mix) 

  • 4X master mix 제공
  • 희석된 샘플에서도 강력한 라이브러리 증폭 가능 

  

Equinox Uracil Tolerant Library Amplification Kit (U+) 

  • 우라실 함유 템플릿 증폭 지원
  • Bisulfite 변환된 DNA, 탈아민화된 DNA 및 FFPE DNA 증폭 가능 

 

◎ 주요 성능 결과


Library amplification with Equinox enables rare mutation detection


고감도 NGS 분석에서는 초고정확도(ultra-high-fidelity) 라이브러리 증폭이 필수적입니다. Equinox®는 자체 개발된 고정확도 교정(polymerase proofreading) polymerase를 활용하여, KAPA HiFi HotStart ReadyMix 대비 polymerase 오류율을 최대 40% 감소시킵니다. 이를 통해 전반적인 오류율을 줄이고, 가짜 변이(false variant call)를 최소화하여 더욱 신뢰할 수 있는 변이 검출이 가능합니다.

 

  • 희귀 변이 검출에 최적화 – 초고정확도 폴리메라아제가 오류율을 낮춰 민감도 향상
  • NGS 데이터 신뢰도 증대 – 거짓 변이 검출 최소화로 정확한 데이터 확보
  • 암 및 후성유전체 연구에 필수적 – C>T 변이 오류 감소로 종양 유전체 연구에서 강력한 성능 제공

 


Low-bias 증폭으로 균일한 UMI 패밀리 커버리지 제공


**Unique Molecular Indices (UMIs, 분자 바코드)**는 시퀀싱 라이브러리 준비 과정에서 PCR 증폭 전에 추가되어, PCR 중복을 정확하게 식별하고 저농도 샘플에서도 변이 검출을 향상시키는 역할을 합니다. 그러나 편향된 증폭(biased amplification)이 발생하면, 특정 분자만 과증폭되어 UMI 패밀리 간 불균형이 심화될 수 있습니다. 이는 단일 리드로만 나타나는 singleton UMI(오류 교정이 불가능한 UMI) 발생을 증가시켜, 희귀 변이 검출을 위한 필수적인 시퀀싱 커버리지를 확보하기 위해 추가적인 시퀀싱 비용이 발생할 수 있습니다.

 

  • 편향 없는 UMI 증폭 지원 – 모든 UMI 패밀리가 균일하게 증폭되도록 설계
  • 효율적인 시퀀싱 데이터 활용 – 추가 시퀀싱 부담 감소, 변이 검출 정확도 향상
  • >75%의 UMI 리드 패밀리에서 균일한 커버리지 제공
  • GC 함량 25~75% 범위에서는 90% 이상의 리드 패밀리가 평균 패밀리 깊이(3X 이내)에서 균일하게 증폭
 

 

고효율 Hot Start 기술 – low-input 샘플과 자동화 워크플로우 최적화


고Equinox® Amplification Master Mix는 강력한 Hot Start 항체 기반 기술을 적용하여, 5’→ 3’ polymerase 활성과 3’→ 5’ exonuclease 활성을 효과적으로 억제합니다. 이를 통해 primer 및 low-input 샘플의 분해를 방지하고, 비특이적 증폭으로 인한 artifacts를 최소화하여 NGS 라이브러리 구축의 민감도를 향상시킵니다.

 

  • Primer 및 low-input 샘플 보호 – 샘플 분해 방지로 신뢰도 높은 데이터 확보
  • 비특이적 증폭 억제 – PCR artifact 최소화로 변이 검출 정확도 향상
  • 자동화 워크플로우 최적화 – 자동화 환경에서도 높은 재현성과 안정성 제공
  • 민감도 개선 – low-input 샘플에서도 정확한 증폭과 균일한 커버리지 보장

주문정보

Equinox® Library Amplification Kits는 희귀 변이 검출(rare variant detection), cfDNA 분석, 단일 세포 분석(single-cell analysis), hybridization capture 등 고도의 정밀성이 요구되는 연구를 위해 설계된 고성능 DNA 증폭 솔루션입니다.
이 키트는 우수한 정확도(fidelity), 균일한 시퀀싱 커버리지, 높은 라이브러리 복잡도(high library complexity)를 제공하여, 특히 민감도가 중요한 연구에서 최적의 성능을 발휘합니다.

◎ Equinox® Library Amplification Kits

 Product

 24 rxn

 96 rxn

 384 rxn

 Equinox Library Amplification Kit Includes P5/P7 Primer Mix(10x)

7K0014-024

7K0014-096

 7K0014-384

 Equinox Library Amplification Kit (w/o primers)

7K0021-024

7K0021-096

 7K0021-384

 Equinox HC Library Amplification Kit Includes P5/P7 Primer Mix (10x)

 -

7K0094-096

 7K0094-384

 Equinox HC Library Amplification Kit (w/o primers)

 -

7K0065-096

 7K0065-384

 Equinox Uracil Tolerant Amplification Kit Includes P5/P7 Primer Mix (10x)

7K0023-024

7K0023-096

 7K0023-384

 Equinox Uracil Tolerant Amplification Kit (w/o primers)

7K0028-024

7K0028-096

 7K0028-384


Literature

  • Equinox Library Amplification Kits Brochure

    다운로드
  • [Poster] Evaluation of library amplification systems for high stringency applications

    다운로드

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