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Watchmaker mRNA Library Prep Kit

Watchmaker mRNA Library Prep Kit는 단 5시간 이내에 mRNA 라이브러리를 구축할 수 있는 최적의 솔루션으로, 핸들링과 정제 단계를 줄여 자동화를 고려한 설계가 적용되었습니다. 2.5 ng ~ 1 µg의 넓은 input 범위를 지원하며, low-input 샘플에서도 고복잡도 라이브러리를 생성할 수 있습니다.

제품설명

⊙ 제품특징

 

  • 5시간 이내에 mRNA 라이브러리 구축 가능 – 하루 안에 실험 완료 가능
  • 2.5 ng까지 낮은 input양에서도 고복잡도 라이브러리 생성
  • 자동화를 위한 on-magnet 세척 방식 도입 – 정제 및 핸들링 단계 최소화
  • RNA 시퀀싱을 위해 최적화된 역전사효소 적용

 

 

⊙ Applications

 

  • Gene expression analysis
  • Gene fusion detection
  • Isoform/alternative splicing analysis
  • Novel transcript discovery
  • Single nucleotide variant (SNV) detection
  • Pathway analysis

 

  

 Figure 1. Illustrative differential gene expression analysis data.

 

⊙ Simple, automatable workflow

Figure 2. A simple, rapid workflow for scalable sample processing. The Watchmaker mRNA Library Prep Kit combines and shortens reaction steps and has fewer cleanups than other commercially available kits. Additionally, it utilizes “on-magnet” bead washing during mRNA capture to omit the need for pipetting to resuspend during washes, as well as reduce magnetting time. Generous reagent overages are included to meet dead volume requirements of liquid handlers.


◎ 주요 성능 결과


Low-input 샘플에서도 높은 데이터 품질 확보


RNA input양이 제한된 샘플에서는 라이브러리 준비 효율이 급격히 감소하여 복잡도가 낮아지고, 생물학적 정보의 활용도가 떨어질 수 있습니다. Watchmaker mRNA Library Prep Kit는 low-input 샘플에서도 최적의 성능을 발휘하도록 설계되었으며, 더 많은 고유 유전자(unique gene)를 검출하여 라이브러리 복잡도를 극대화합니다.

  

시퀀싱 효율 극대화 및 비용 절감


시퀀싱 과정에서 의미 없는 rRNA와 중복 리드는 전체 데이터 용량을 차지하여 실험 비용을 증가시킵니다. Watchmaker mRNA Library Prep Kit는 우수한 mRNA 농축(mRNA enrichment) 성능을 제공하며, 2.5 ng에서 1 µg까지 400배에 이르는 넓은 input양 범위에서도 높은 라이브러리 준비 효율을 유지합니다. 이를 통해, 낮은 input양에서도 별도의 특수 키트 없이 동일한 워크플로우로 실험이 가능하며, strand origin 정보도 유지할 수 있습니다.

  

Low-input 샘플에서도 유전자 발현 데이터의 정량성 보존


Transcriptome 시퀀싱의 핵심 목표는 샘플 내 생물학적 정보를 정확하게 반영하는 데이터 생성입니다. 하지만, 많은 기존 상용 솔루션은 input양이 낮을 경우 데이터 왜곡을 초래하여, 특히 저발현 유전자의 상대적 커버리지가 손실되는 문제가 발생합니다. Watchmaker mRNA Library Prep Kit는 넓은 input양 범위에서도 정량적인 유전자 발현 데이터를 제공하여, 신뢰할 수 있는 연구 결과를 지원합니다.

  

GC-rich 영역에서도 균일한 염기 커버리지 제공


균일한 transcript 커버리지는 alternative splicing 및 isoform analysis과 같은 민감한 응용 분야에서 필수적입니다. Watchmaker mRNA Library Prep Kit는 input양이 다양해도 일관된 커버리지 균일성을 유지하며, 특히 Equinox DNA Polymerase를 활용하여 GC-rich 영역에서도 높은 시퀀싱 커버리지를 제공합니다.

  

주문정보

◎ Watchmaker mRNA Library Prep Kit

 

 Description

 24 rxn

96 rxn 

Watchmaker mRNA Library Prep Kit

incl. reagents required for mRNA capture, RNA library prep, and amplification

 7BK0001-024

7BK0001-096

Literature

  • mRNA Library Prep Kit Brochure

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  • Surveying the RNA-seq landscape: A multi-workflow comparison for mRNA and whole transcriptome sequencing applications. As presented at ESHG 2024; includes Element AVITI and Singular G4 performance data

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