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Watchmaker DNA Library Prep Kit

Watchmaker DNA Library Prep Kits는 템플릿 DNA를 효율적으로 시퀀싱 가능한 라이브러리 분자로 전환하여 커버리지를 향상시키고, 특히 low-input 액체 생검 샘플(cfDNA, ctDNA)에서도 경제적인 시퀀싱을 가능하게 합니다. 자동화 친화적인 워크플로우를 통해 단편화된 DNA를 활용한 강력하고 유연한 라이브러리 준비가 가능하며, WGS(전장유전체 시퀀싱) 및 타겟 시퀀싱과 같은 다양한 연구에 적용할 수 있습니다.
또한, cfDNA, FFPE, ChIP과 같은 까다로운 샘플에서도 편향과 artifact를 최소화하며, 초고정확도 polymerase를 적용하여 polymerase 오류를 줄여줍니다. DNA 메틸화 분석이 필요한 경우, Equinox® Uracil Tolerant Library Amplification Kits와 함께 사용할 수 있습니다.

제품 설명

 ⊙ 제품 특징

  • 더 많은 DNA를 시퀀싱 가능한 라이브러리로 변환 → 특히 임상적으로 중요한 cfDNA에서 민감도 향상
  • High-complexity 라이브러리 구축 가능 → 500 pg ~ 1 µg의 다양한 샘플 지원
  • 자동화가 용이한 간단한 워크플로우 → 2시간 이내 빠른 라이브러리 준비 가능
  • 메틸화 시퀀싱 분석 지원 → Equinox Uracil Tolerant Amplification Kits와 함께 사용 시 높은 수율과 균일성 제공 

 

⊙ Applications

  • cfDNA and circulating tumor DNA (ctDNA) analysis
  • DNA methylation analysis* (Methyl-seq)
  • Chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq)
  • Somatic mutation calling and other low-frequency variant detection assays
  • Inherited disease sequencing
  • Fragmentomics
  • Human whole genome sequencing (WGS), including PCR-free
  • Whole exome sequencing (WES)
  • Microbial and metagenomic sequencing
  • Viral genome sequencing
  • Amplicon sequencing

 

* In combination with Equinox Uracil Tolerant Library Amplification Kits

 

⊙ Workflow

Figure 1. Simple and automatable DNA library prep workflows. Both the Watchmaker DNA Library Prep Kit (required for cfDNA and DNA methylation analysis) and the Watchmaker DNA Library Prep Kit with Fragmentation (suitable for FFPE library prep and other genomics applications) enable library prep in as few as two hours and were designed with automation in mind, including generous overages.

 

◎ 주요 성능 결과

 

Input DNA의 높은 변환 효율로 커버리지 및 복잡도 향상

Watchmaker DNA Library Prep Kit는 low-input 샘플에서도 우수한 변환 효율을 제공하여, 템플릿 제한이 있는 연구(예: 액체 생검)에 적합합니다. Input DNA가 효과적으로 adapter-ligation된 라이브러리로 전환됨으로써 라이브러리 복잡도와 커버리지가 향상됩니다.

  

 

액체 생검 샘플에서 업계 최고 수준의 성능 제공

자연적으로 절편화된 cell-free DNA(cfDNA)는 종양학, 산전 검사, 이식 연구 등 다양한 분야에서 비침습적 바이오 마커로 활용되며, 연구 패러다임을 바꾸고 있습니다. 

Watchmaker DNA Library Prep Kit는 직접 cfDNA 시퀀싱 및 타겟 cfDNA 시퀀싱을 모두 지원하며, 샘플 손실, 어댑터 dimer 오염, 편향 및 artifact를 최소화하는 최적의 워크플로우를 제공합니다.

  

 

액체 생검 샘플에서 변이 검출 민감도 향상

액체 생검 연구에서는 매우 낮은 빈도의 변이(1% 이하)를 제한된 샘플에서 검출해야 합니다.

Watchmaker DNA Library Prep Kit는 cfDNA 템플릿의 변환 효율을 극대화하여 높은 라이브러리 복잡도를 유지하고, 깊은 커버리지를 확보함으로써 변이 검출의 민감도와 신뢰도를 향상시킵니다.

  

 

FFPE 샘플에서 커버리지 향상

FFPE 샘플은 임상 연구에서 광범위하게 사용되지만, 품질이 일정하지 않고 input양이 제한적이기 때문에 분석이 까다롭습니다. Watchmaker DNA Library Prep Kit with Fragmentation은 FFPE 샘플에서 높은 성능을 제공하며, 기존에 절편화된 FFPE 샘플이나 sonication을 이용한 절편화가 필요한 환경에서도 최적의 워크플로우를 지원합니다.

  

 

 

 

주문정보

Watchmaker DNA Library Prep Kit

 

 Description

 24 rxn

 96 rxn

Watchmaker DNA Library Prep Kit

incl. Equinox Library Amplification Master Mix (2X) and P5/P7 Primer Mix (10X)

 7K0102-024

 7K0102-096

Watchmaker DNA Library Prep Kit (PCR-free)

 7K0101-024

 7K0101-096

Watchmaker DNA Library Prep Kit

(w/o primers); incl. Equinox Library Amplification Master Mix (2X)

 7K0103-024

 7K0103-096


Literature

  • Streamline Watchmaker’s DNA Library Prep Kit for pre-fragmented DNA on the Sciclone G3 NGSx Workstation

    다운로드
  • Watchmaker DNA Library Prep Kits Brochure

    다운로드

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#NGS

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#DNA